ESAÜ juhatuses on põhikirja järgi 5-7 liiget. Juhatuse liige peab olema ühingu liige, teovõimeline füüsiline isik, kellel on laitmatu reputatsioon ning kes valdab suhtlustasandil inglise keelt. Juhatus saab üldkoosolekult volitused kaheks aastaks. Juhatuse esimehe, aseesimehe ja finantsjuhi valivad juhatuse liikmed endi hulgast. Juhatuse liikme töö eest tasu ei maksta, tegutseme pro bono.
Alates 15.05.2025 on ESAÜ juhatuse liikmed ja nende rollid järgmised:
- Gert Schultz, juhatuse esimees
Vastutusvaldkond: rahvusvahelised koostöösuhted, koostöö kõrg- ja ülikoolidega.
- Aire Kirss, juhatuse aseesimees
Vastutusvaldkond: eestisisesed koostöösuhted
- Laura Lätt, juhatuse liige
Vastutusvaldkond: finantsjuht.
- Margit Krieger, juhatuse liige
Vastutusvaldkond: sertifitseerimisküsimused, eestisisesed koostöösuhted.
- Norman Vester, juhatuse liige
Vastutusvaldkond: IT-arendused, koostöö kõrg- ja ülikoolidega.
- Piret Kustasson-Seilmaa, juhatuse liige
Vastutusvaldkond: koolitustega seotud teemad.
- Terje Keerberg, juhatuse liige
Vastutusvaldkond: eestisisesed koostöösuhted (sh Lõuna-Eestis).